Écologie microbienne
À propos du Laboratoire d'écologie microbienne
Grâce à son laboratoire d’écologie microbienne (LEM), l’IRDA réalise des analyses de communautés microbiennes et d’identification de microorganismes (archées et bactéries, champignons et autres eucaryotes) dans le cadre de projets de recherche ou de contrats de service analytique. Ces microorganismes peuvent être bénéfiques ou pathogènes à des végétaux, ils peuvent être prélevés dans une biomasse, dans un sol, dans l’air ou dans l’eau, ou encore ils peuvent être impliqués dans des processus de traitement d’effluents ou de production d’énergie.
Offre de service
Analyses offertes
Analyse métagénomique Illumina MiSeq (2x300bp) (bactéries, archées, champignons, microfaune).
Analyse d’amplification quantitative qPCR (archées, bactéries, champignons, eucaryotes) utilisée pour quantifier l’ensemble d’une population ou une espèce spécifique.
Analyse d’amplification quantitative qPCR spécifique (gènes impliqués dans le métabolisme de l’azote et du carbone, détection d’organismes pathogènes).
Résultats attendus et applications
Évaluation de la richesse microbienne d’un échantillon.
Évaluation de la composition microbienne d’un échantillon.
Comparaison de la diversité microbienne entre des traitements.
Identifications taxonomiques de groupes microbiens bénéfiques et pathogènes.
Détermination des fonctions potentielles des microorganismes d’un échantillon.
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Autorisation pour divulguer des résultats